Denizli ve Gerze Tavuk Populasyonlarındaki Genetik Çeşitliliğin Bazı Mikrosatelit Markörler Kullanılarak Belirlenmesi


Kaya M., Yıldız M. A.(Yürütücü), Özdil F.

TÜBİTAK Projesi, 2006 - 2007

  • Proje Türü: TÜBİTAK Projesi
  • Başlama Tarihi: Mayıs 2006
  • Bitiş Tarihi: Kasım 2007

Proje Özeti

Türkiye yerli gen kaynaklarından Denizli ve Gerze tavuk ırkları ADL0102, ADL0136, ADL0158, ADL0171, ADL0172, ADL0176, ADL0181, ADL0210, ADL0267 ve ADL0268 mikrosatelit lokusları bakımından tanımlanmıştır. Toplam 125 örnek (75 adet Denizli, 50 adet Gerze) materyal olarak kullanılmıştır. Mikrosatelit lokuslar bakımından ortalama allel sayısı (Na) 7.5±0.76, etkili allel sayısı (Ne) 3.513±0.52, gözlenen heterozigotluk (Ho) 0.457±0.04, beklenen heterozigotluk (He) 0.665±0.04, polimorfizm bilgi içeriği (PIC) 0.610±0.05 ve akrabalı yetiştirme katsayısı (FIS) 0.301±0.05 olarak tahmin edilmiştir.

Denizli ve Gerze ırklarında sırasıyla Na (6.1±0.6 ve 5.0±0.7), Ho (0.508±0.037 ve 0.380±0.065), He (0.656±0.045 ve 0.475±0.074), PIC (0.599±0.049 ve 0.426±0.068) ve FIS (0.226±0.043 ve 0.200±0.070) genetik varyasyon ölçüleri hesaplanmıştır.

Denizli ve Gerze ırklarında tüm lokuslar üzerinden F-istatistikleri (FIS=0.1467, FIT=0.3878 ve FST=0.1888) ve gen akışı (Nm=1.0742) belirlenmiştir.

Denizli ve Gerze ırkları arasındaki genetik farklılık FST (0.1888) ve D (0.4758) olarak hesaplanmıştır.

En yakın komşu (NJ) metodu kullanılarak yapılan kümeleme analizi sonucunda, Denizli ve Gerze ırklarına ait populasyonların birbirlerinden oldukça farklı gruplarda yer aldığı ortaya konmuştur.

Denizli ve Gerze ırklarının birbirlerinden ayrımında kullanılabilecek özgün alleller belirlenmiştir.

Denizli ve Gerze ırklarında genetik çeşitliliğin yüksek olduğu ve bu ırkların birbirlerinden oldukça farklı genetik yapılara sahip bulunduğu tespit edilmiştir.