bulunmaktadır. Günümüzde çiftlik hayvanı ırk ve tiplerinde filogenetik ilişkinin belirlenmesinde Basit Dizi Tekrarları ve Tek Nükleotid Polimorfizmleri en yaygın kullanılan moleküler tekniklerdir. Bununla birlikte, bütçe ve zaman gibi sınırlayıcı koşullarda filogenetik analiz yapabilmek için alternatif moleküler teknikler tercih edilebilir. Bu bağlamda, mevcut çalışmada genetik mesafe temelli filogenetik ilişkinin ortaya çıkarılmasında Basit Dizi Tekrarları ve Polimeraz Zincir ReaksiyonuRestriksiyon Parça Uzunluk Polimorfizmi teknikleri karşılaştırılmıştır. Materyal ve Metot: Bu çalışmada filogenetik ilişki analizi için 11 farklı yumurtacı saf hattın her birinden 30’ar birey 11 PCR-RFLP ve 17 SSR lokus temelinde genotiplendirilmiştir. Bulgular: Genetik mesafe temelinde oluşturulan UPGMA dendogramı bakımından her iki teknik benzer sonuçlar göstermiştir. Hem Polimeraz Zincir ReaksiyonuRestriksiyon Parça Uzunluk Polimorfizmi hem de Basit Dizi Tekrarları tekniği ile beyaz ve kahverengi yumurtacı hatlar genetik köken ve yetiştirilme geçmişlerine uygun olarak ayrılmıştır. Sonuç: Bütçe, zaman ve laboratuvar alt yapısı kısıtlı olduğunda, genetik mesafe temelli filogenetik ilişkinin incelenmesinde Polimeraz Zincir Reaksiyonu- Restriksiyon Parça Uzunluk Polimorfizmi tekniğinin kullanılabileceği önerilmektedir.
Objective: Many molecular tools are available to analyse phylogenetic relationshipsin livestock. Nowadays, Simple Sequence Repeats and Single NucleotidePolymorphisms are commonly used molecular techniques to determinephylogenetic relationships in livestock breeds or types. However, alternativemolecular techniques may be preferred to conduct phylogenetic analysis in case oflimiting conditions such as budget and time. In this context, in the present study,Simple Sequence Repeats and Polymerase Chain Reaction- Restriction FragmentLength Polymorphism techniques were compared to reveal phylogeneticrelationship based on genetic distances.Material and Methods: In this study, 11 different layer pure chicken linesrepresented by 30 individuals for each line were genotyped based on 11 PolymeraseChain Reaction- Restriction Fragment Length Polymorphism and 17 SimpleSequence Repeats loci to analyse phylogenetic relationship.Results: Both techniques showed almost similar results in terms of Unweighted PairGroup Method with Arithmetic Mean dendrogram created based on geneticdistances. White and brown chicken lines were separated by both Polymerase ChainReaction- Restriction Fragment Length Polymorphism and Simple Sequence Repeatstechniques in harmony with their genetic origins and breeding history.Conclusion: It is suggested that Polymerase Chain Reaction- Restriction FragmentLength Polymorphism technique may be preferred to analyse phylogeneticrelationship based on genetic distance, when the budget, time and laboratoryinfrastructure are limited.
