Malign melanoma olgularında EGFR, TP53, P16 ve MDM2 genlerinin FISH ile değerlendirilmesi
Tezin Türü: Yüksek Lisans
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Eskişehir Osmangazi Üniversitesi, SAĞLIK BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ, TIBBİ GENETİK ANABİLİM DALI, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2018
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: TOLGA TÖRE
Danışman: BEYHAN DURAK ARAS
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Malign melanom, melanin üretmekle sorumlu olan melanositlerin değişimi ile meydana gelen kanser türüdür. Mortalite oranı yüksek olan malign melanomun her yıl insidansında artış olacağı düşünülmektedir. Bu çalışmada, malign melanom olgularında EGFR, P16, TP53 ve MDM2 gen bölgelerine ait aberasyonların FISH yöntemi ile ortaya konulması amaçlanmıştır. Histopatolojik olarak tanı almış 16 malign melanom ve 24 melanositik nevüs olgusu çalışmaya dahil edilmiştir. Hasta ve kontrollere ait deparafinize edilmiş doku preparatlarında FISH yöntemi kullanılarak EGFR, TP53, P16 ve MDM2 bölgelerine ait kopya sayısı değişiklikleri incelenmiştir. Elde edilen sonuçlara göre 16 malign melanom olgusunun 7'sinde (%43,75) en az 1 aberasyon, 4'ünde en az 2 aberasyon gözlenmiştir. Yirmidört melanositik nevüs olgusunun 4'ünde (%17) aberasyon saptanmıştır. Malign melanom olgularında en sık gözlenen anomali EGFR gen amplifikasyonu (%43,75) olarak saptanmıştır. Malign melanom ve melanositik nevüs arasında EGFR amplifikasyonu açısından anlamlı bir fark bulunmuştur. Malign melanom olgularında araştırmış olduğumuz gen kopya sayısı anomalileri (EGFR amplifikasyonu, MDM2 amplifikasyonu, TP53 delesyonu, P16 delesyonu) ile histopatolojik özellikler (ülser, lenf infitrasyonu, büyüme tipi) ve kanser tipi arasında bir ilişki gözlenmemiştir. Ancak malign melanomlarda EGFR ve MDM2 genlerinin koamplifikasyonu arasında istatistiksel olarak anlamlı ve orta düzeyde bir uyum bulunmuştur. Ayrıca TP53 gen delesyonu ile MDM2 gen amplifikasyonu arasında istatistiksel olarak anlamlı ve orta düzeyde bir uyum bulunmuştur. Çalışmamız sonucunda melanom ve nevüs tanısı ayrımında EGFR gen amplifikasyonun kullanılabilir olabileceği ve MDM2 geni ile EGFR geni arasında bulunan uyumun moleküler düzeyde de araştırılarak tümör oluşum ve gelişimi hakkında yeni ipuçları elde edilebileceği düşünülmektedir. Anahtar kelimeler: Malign melanom, EGFR, TP53, MDM2, P16, FISH