Prenatal tanıda sık görülen anöploidilerin multiplex ligation-dependent amplification (mlpa) yöntemi ile saptanması
Tezin Türü: Doktora
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Eskişehir Osmangazi Üniversitesi, SAĞLIK BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ, TIBBİ GENETİK ANABİLİM DALI, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2007
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: HÜSEYİN YURDAKUL
Danışman: BEYHAN DURAK ARAS
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Gelismis ülkelerde kromozom anomalilerinin sebep oldugu sendromların prenatal tanısı obstetrik takibin önemli bir parçasıdır. Anöploidi tanı testlerinde altın standart, klasik kromozom analizidir (karyotipleme). Bununla birlikte Florasan In Situ Hibridizasyon ( FISH ) ve short tandem repeats (STRs) analizleri moleküler sitogenetik ve moleküler genetik testler olarak spesifik anomalilerin tanısında rutin uygulamada kullanılmaktadır. MLPA; farklı DNA dizilerinin tek bir reaksiyonda relatif kantitasyonuna imkan veren yeni bir teknik olarak ortaya çıkmıstır. Retrospektif ve prospektif olarak yapılan çalısmamızda anöploidi riski tasıyan 500 gebeden alınan amniyon sıvısında MLPA teknigi kullanılarak 13., 18., 21., X ve Y kromozomlarının doz tayini yapılmıstır. Çalısmamızda, riskli gebelerden alınarak Ana Bilim Dalı'mıza gönderilen amniyotik sıvıdan 2 cc ayrılarak fetal hücrelerin DNA ları ekstrakte edilmistir. Fetal DNA daki 13., 18., 21., X ve Y kromozomlarının dozajlarının belirlenmesi amacı ile bu kromozomlara spesifik probların PCR ile amplifikasyonu yapılmıstır. Elde edilen PCR ürününde 310 Prizm Genetic Analyzer cihazında Gene Mapper programı kullanılarak amplifiye olan probların miktarını gösteren pikler elde edilmistir. Piklerin alanları Coffalyser programı ile analiz edilerek adı geçen kromozomların doz tayini yapılmıstır. MLPA teknigi ile elde edilen sonuçlar rutin yöntemlerle elde edilen sonuçlar ile karsılastırılarak testin sensitivitesi ve spesifitesi belirlenmistir. MLPA tekniginin rutinde kullanılabilirligi sınanmıs ve yeni yöntemin rutinde kullanılan yöntemlere göre avantaj ve dezavantajları belirlenmistir. Yapılan çalısma sonrasında örneklerin 480 tanesinde MLPA yöntemi ile sonuçlar tayin edilebilmistir. Triploidi saptanan bir olgu (69,XXX) dısındaki, tüm olgu örneklerinde karyotip sonuçları ile MLPA sonuçları uyumlu bulunmustur.