Primer kardiyomiyopatilerde MTDNA varyantlarının değerlendirilmesi
Tezin Türü: Yüksek Lisans
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Eskişehir Osmangazi Üniversitesi, SAĞLIK BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ, TIBBİ GENETİK ANABİLİM DALI, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2020
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: MEHMET ARDA TEMENA
Danışman: OĞUZ ÇİLİNGİR
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Primer kardiyomiyopatiler, kalp kasında meydana gelen bozukluklar sonucu ortaya çıkan herhangi bir disfonksiyona sekonder gelişmeyen ve büyük ölçüde genetik altyapısı bulunduğu düşünülen bir hastalık grubudur. Kardiyomiyopati dünyada kalp yetmezliğinin ve gençlerde kalbe bağlı ani ölümün en önemli nedenlerinden birisi olmasına rağmen, kalp transplantasyonu haricinde mevcut tedaviler semptomların hafifletilmesi üzerine kuruludur. Kalıcı bir çözüm bulmak amacıyla genetik varyasyona yönelik tedaviler göz önünde bulundurulduğunda ise mitokondriyal DNA (mtDNA) son zamanlarda birçok araştırmanın önemli bir konusu olmuştur. mtDNA üzerinde saptanan varyantların bir kısmı enerji ihtiyacı yüksek kalp, beyin gibi organlardaki hem yapısal hem de fonksiyonel sorunlarla ilişkilendirilmiştir. Kardiyomiyopatiye neden olduğu bilinen miyokard bazında meydana gelen bozuklukların, çoğunlukla biyoenerjetik yolaklardaki mitokondriyal etkileşimlerden kaynaklı olabileceği düşünülmektedir. Kesin bir tedavi geliştirilebilmesi için de hastalığın mitokondri genetiği açısından etyopatogenezinin aydınlatılması gerekmektedir. Ancak bu yaklaşımla yapılan sınırlı sayıda çalışma bulunmaktadır. Bu bilgiler ışığında, çalışmamızda primer kardiyomiyopati üzerinde direkt etkisi olduğunu ve hastalığın progresyonuna katkısı olduğunu düşündüğümüz mtDNA varyantlarının incelenmesi için tüm mtDNA dizilemesi yapmayı planlamaktayız. Bu çalışmada, mtDNA tarafından eksprese edilen 37 gen (iki rRNA, 22 tRNA ve oksidatif fosforilasyonda direkt görev alan 13 mitokondriyal protein) yeni-nesil dizilme yöntemiyle dizilenecek olup, aday patojenik mutasyonlar ve hastalığa etkisi olduğu düşünülen tek nükleotid polimorfizmlerinin (SNPs) biyoinformatik araçlarla tanımlanması ve klinik üzerindeki etkilerinin araştırılması amaçlanmıştır. Aynı zamanda etnik/bölgesel haplogrup varyasyonlarının yorumlanması ile birlikte Türkiye mtDNA haplogrup veri haritasına bu denli katkıda bulunacak ilk çalışma olacaktır.