Küçük hücreli olmayan akciğer kanserleriyle ilişkilendirilmiş tümör süpressör genlerin multıplex lıgatıon-dependent probe amplıfıcatıon (mlpa) yöntemi ile metilasyon paternlerinin incelenmesi

---

Tezin Türü: Doktora

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Eskişehir Osmangazi Üniversitesi, SAĞLIK BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ, TIBBİ GENETİK ANABİLİM DALI, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2007

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: AHMET ULUDAĞ

Danışman: SEVİLHAN ARTAN

Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu

Özet:

Akcier kanseri, tüm dünyada mortalitesi en yüksek kanser türüdür ve kardiyovasküler hastalıklardan sonra ölüm nedenleri arasında 2. sırada yer almaktadır. Metilasyon bir epigenetik mekanizma olup DNA düzeyinde herhangi bir mutasyon olmamasına ramen ilgili genin eksprese olmasını engelleyen bir moleküler mekanizmadır. Çalımada henüz çok yeni bir yöntem olan Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification (MLPA) teknii ile akcier kanserleriyle daha önce ilikilendirilmi 24 ayrı tümör süpressör genin promoter bölgelerinin metilasyon paternlerinin SALSA MSMLPA ME001 tumorsuppressor probemix kiti kullanılarak incelenmesi amaçlanmıtır. Bu çalımaya stanbul Yedikule Göüs Hastalıkları Hastanesinde, histopatolojik olarak incelenerek ?küçük hücreli olmayan akcier kanseri? tanısı almı 100 olgu dahil edildi..Her hastaya ait doku örneklerinden kanser dokusu içeren 5 mikronluk kesitlerden elde edilen DNA örnekleri çalıma grubu olarak, aynı hastaya ait kanser dokusu içermeyen kesitlerden elde edilen DNA örnekleri de kontrol grubu olarak çalımaya alındı. Çalımada, akcier kanserli tümöral ve çevre akcier dokularında birbirlerine yakın oranlarda en sık CDKN2B, BRCA1, CDH13 ve HIC1 prob bölgelerinde metilasyon görüldü. Yine tümöral ve çevre dokularda PTEN, TIMP3, ATM, VHL, CD44, CDKN1B, RASSF1, IGSF4 ve ESR1 prob bölgelerinde de metilasyon saptandı. APC, CDKN2A, MLH1, RARB, CHFR ve GSTP1 prob bölgelerinde farklı oranlarda, tümöral dokularda metilasyon görülürken, çevre akcier dokularında bu prob bölgelerinde metilasyon saptanmadı. Sonuç olarak MS MLPA yönteminin akcier kanserlerinin metilasyon profillerinin taramasında kullanılabilecek, ucuz ve hızlı sonuç verebilen bir teknik olduu görülmütür. MS MLPA yönteminin dier metilasyon tarama yöntemleriyle karılatırılarak bir an önce senstivite ve spesivitesinin belirlenmesi ve akcier kanserinin erken tanısında rutin kullanıma geçirilmesi gerektiini düünmekteyiz.