Moleküler Sentezleme ve
FT-IR Spektroskopi Araştırma Laboratuvarında yapılan çalışmalar üç aşamadan
oluşmaktadır. Birinci aşamada, kompleks oluşumunda kullanılacak moleküller DFT-B3LYP yöntemi
LANL2DZ baz seti kullanılarak Gaussian 09W paket programı ile bilgisayar
ortamında modellenir ve taban durumda optimize edilir. Optimize edilmiş
geometrinin, moleküler yapısı, geometrik parametreleri (bağ uzunlukları, bağ
açıları, dihedral açıları) ve konformasyon enerjisi hesaplanır. Optimize
edilmiş geometrik yapı molekülün normal mod titreşim frekansları ve bunlara
karşılık gelen titreşim işaretlemelerini bulmak için kullanılmaktadır. Ayrıca, moleküllerin
zamana bağlı yoğunluk fonksiyonel teorisi (TD-DFT) B3LYP yöntemi LANL2DZ baz
seti kullanılarak elektronik geçiş enerjileri hesaplanır. Yapılan hesaplamalar
sonucunda molekülün HOMO (En yüksek işgal edilmiş moleküler orbital) ve LUMO
(en düşük işgal edilmemiş moleküler orbital) enerji seviyeleri ile molekül
içindeki elektron verici ve alıcı gruplar belirlenir. Zamana bağlı
yoğunluk fonksiyonel teorisi moleküllerin Cd, Zn, Cu gibi bazı geçiş metalleri
ile oluşturacağı komplekslerin elektrostatik potansiyel enerji haritalarını
etmek için kullanılmaktadır. Bu sayede molekülün elektronegatifliği, kompleks oluşumundaki elektronik etkileşmeleri, ligantın
ve metalin davranışı hakkında bilgilere ulaşılmaktadır.