Dr. Öğr. Üyesi SERKAN ÖNDER

Yayın Ağı

Makaleler 35

1. **First report of watermelon crinkle leaf-associated virus 1 (Coguvirus citrulli) infecting watermelon (Citrullus lanatus) in Türkiye**

Kizmaz M. Z., ÖNDER S.

JOURNAL OF PLANT PATHOLOGY , 2025 (SCI-Expanded, Scopus)

2. A Virome Scanning of Saffron (Crocus sativus L.) at the National Scale in Iran Using High-Throughput Sequencing Technologies

Valouzi H., Dizadji A., Golnaraghi A., Salami S. A., Fontdevila Pareta N., Önder S., et al.

VIRUSES , cilt.17, sa.8, ss.1-23, 2025 (SCI-Expanded)

3. Virome Survey of Banana Plantations and Surrounding Plants in Malawi

Masangwa J. I. G., Temple C., Rollin J., Maclot F., Önder S., Kamwendo J., et al.

VIRUSES , cilt.17, sa.8, ss.1-20, 2025 (SCI-Expanded)

4. Marmara bölgesinde sert çekirdekli meyve ağaçlarında şarka hastalığının (plum pox virus=PPV) tespiti ve moleküler karakterizasyonu

UZUNOĞULLARI N., ÖNDER S.

Harran Tarım ve Gıda Bilimleri Dergisi , cilt.29, sa.2, ss.255-268, 2025 (Hakemli Dergi)

5. Investigation of Viral Agents in Walnut (Juglans spp.) Trees by High Throughput Sequencing from Niğde province, Türkiye

Makbule Temeltürk B., ÖNDER S., ULUBAŞ SERÇE Ç.

KSU TARIM VE DOGA DERGISI-KSU JOURNAL OF AGRICULTURE AND NATURE , cilt.28, sa.3, ss.820-829, 2025 (ESCI)

6. First detection of saffron dwarf virus, wheat dwarf virus, wheat dwarf virus-associated alphasatellite and a new putative potyvirus species in saffron in Iran

Valouzi H., Dizadji A., Golnaraghi A., Salami S. A., Selmi I., Fontdevila Pareta N., et al.

New Disease Reports , cilt.51, sa.1, ss.1-2, 2025 (Scopus)

7. Genetic diversity and population structure of grapevine Roditis leaf discoloration‐associated virus in Turkey vineyards

Ulubaş Serçe Ç., Aydınlık S., Öztürk Z. N., Önder S., Çiftçi O., Altan B.

JOURNAL OF PHYTOPATHOLOGY , cilt.172, sa.4, ss.1-11, 2024 (SCI-Expanded)

8. Molecular Identification and Pathogenicity of Fusarium Species Associated with Wood Canker, Root and Basal Rot in Turkish Grapevine Nurseries

Akgül D. S., Önder S., Güngör Savaş N., Yıldız M., Bülbül İ., Özarslandan M.

JOURNAL OF FUNGI , cilt.10, sa.444, ss.1-20, 2024 (SCI-Expanded)

9. Clonal Preselection in Grape (Vitis vinifera L.) Varieties of Ekşi Kara and Gök Üzüm

KARA Z., ÖZ M. H., SABIR A., YAZAR K., DOĞAN O., Khaleel Khaleel A. J., et al.

SELCUK JOURNAL OF AGRICULTURE AND FOOD SCIENCES , cilt.37, sa.3, ss.444-456, 2023 (Hakemli Dergi)

10. Detection of single nucleotide polymorphisms in virus genomes assembled from high-throughput sequencing data: large-scale performance testing of sequence analysis strategies

Rollin J., Bester R., Brostaux Y., Caglayan K., De Jonghe K., Eichmeier A., et al.

PEERJ , cilt.11, 2023 (SCI-Expanded)

11. Looking beyond Virus Detection in RNA Sequencing Data: Lessons Learned from a Community-Based Effort to Detect Cellular Plant Pathogens and Pests.

Haegeman A., Foucart Y., De Jonghe K., Goedefroit T., Al Rwahnih M., Boonham N., et al.

Plants (Basel, Switzerland) , cilt.12, sa.11, 2023 (SCI-Expanded)

12. ASSESSMENT OF A FORECAST-WARNING MODEL FOR THE CONTROL OF GRAPEVINE POWDERY MILDEW IN THE AEGEAN REGION IN TURKEY

Savas N. G., AKGÜL D. S., Albaz E., Savas Y., ÖNDER S.

FRESENIUS ENVIRONMENTAL BULLETIN , cilt.31, sa.3, ss.2840-2849, 2022 (SCI-Expanded)

13. Effects of Shoot Tip Size on In Vitro Regeneration and Virus Elimination of Grapevine cv. Superior Seedless

Saygaç S., Önder S.

Plant Protection Bulletin , cilt.61, sa.3, ss.5-9, 2021 (Hakemli Dergi) Sürdürülebilir Kalkınma

14. Manisa ilinde Bağda külleme hastalığının (Erysiphe necator Schw.) kimyasal mücadelesinde farklı ilaçlama programlarının değerlendirilmesi

Güngör Savaş N., Albaz E., Önder S.

Bitki Koruma Bülteni , cilt.60, sa.2, ss.55-62, 2020 (Hakemli Dergi)

15. Phylogenetic relationships and genetic structure of populations of turnip mosaic virus in Turkey

Korkmaz S., Cevik B., Karanfil A., Onder S., Ohshima K.

EUROPEAN JOURNAL OF PLANT PATHOLOGY , cilt.156, sa.2, ss.559-569, 2020 (SCI-Expanded)

16. Studies on the prevalence of several newly-identified viruses infecting grapevines in Turkey

Ulubaş Serçe Ç., Önder S., Çiftçi O., Altan B., Öztürk Gökçe Z. N., Elçi E.

ISHS Acta Horticulturae , cilt.1269, sa.1269, ss.105-111, 2020 (Scopus)

17. COMPARISON OF REAL-TIME PCR, RT-PCR AND MOLECULAR HYBRIDIZATION TECHNIQUES FOR THE DIAGNOSIS OF GYSVD-1 (GRAPEVINE YELLOW SPECKLE VIROID-1) IN GRAPEVINES

PAYLAN İ. C., Candar A., ÖNDER S., GÜNEŞ N., GÜMÜŞ M., Erkan S.

FRESENIUS ENVIRONMENTAL BULLETIN , cilt.27, sa.5A, ss.3326-3331, 2018 (SCI-Expanded)

18. SUSCEPTIBILITY OF GRAPEVINE CULTIVARS AND ROOTSTOCKS TO CROWN GALL DISEASE (RHIZOBIUM VITIS) IN THE AEGEAN REGION OF TURKEY

Akgül D. S., Özyılmaz Ü., Önder S., Celik S., Soltekin R. O., Benlioğlu K.

FRESENIUS ENVIRONMENTAL BULLETIN , cilt.27, sa.9, ss.6229-6238, 2018 (SCI-Expanded) Sürdürülebilir Kalkınma

19. First Report of Grapevine Roditis leaf discoloration-associated virus Infecting Grapevine (Vitis vinifera) in Turkey

Ulubaş Serçe Ç., Altan B., Bolat V., Ayaz M., Çiftçi O., Önder S., et al.

Plant Disease , cilt.102, sa.1, ss.256-257, 2018 (SCI-Expanded)

20. Fungisit uygulama programlarının cardinal ve sultani çekirdeksiz üzüm çeşitlerinde kalite kriterleri ile asma küllemesi ve mildiyö hastalıklarının kontrolüne etkileri

Akgül D. S., Önder S., Merken Ö., Kesgin M., Yağcı A.

Bitki Koruma Bülteni , cilt.57, sa.3, ss.373-390, 2017 (Hakemli Dergi)

21. Grapevine fanleaf nepovirus (GFLV)’ün Tanılanmasında Konvansiyonel RT-PCR ile Real-Time RT-PCR Tekniklerinin Karşılaştırılması

Önder S., Paylan İ. C., Gümüş M.

The Journal of Turkish Phytopathology , cilt.45, ss.53-62, 2016 (Hakemli Dergi)

22. Ege Bölgesi Bağ Alanlarında Sorun Olan Bazı Viral Etmenlerin Real-time PCR ile Teşhisi

Önder S., Paylan İ. C., Gümüş M.

The Journal of Turkish Phytopathology , cilt.45, sa.1, ss.21-30, 2016 (Hakemli Dergi)

23. RNAi Teknolojisi ve Fitopatolojide Kullanım Alanları

Topkaya Kütük B., Önder S., Çevik B.

Bahçe , cilt.45, ss.569-573, 2016 (Hakemli Dergi)

24. Ege Bölgesi’nde Yetiştirilen Üzüm Çeşitlerinde Grapevine fanleaf nepovirus (GFLV)’nin Yaygınlık Durumu

Önder S., Akgül D. S., Gümüş M., Paylan İ. C.

Selçuk Tarım ve Gıda Bilimleri Dergisi-A , cilt.27, ss.627-636, 2015 (Hakemli Dergi)

25. Farklı Asma Anaçları ile Aşılı Red Globe Üzüm Çeşidinin Fidan Randımanı Üzerine Bir Çalışma

İşçi B., Altındişli A., Kaçar E., Dilli Y., Soltekin R. O., Önder S., et al.

Selçuk Tarım ve Gıda Bilimleri Dergisi-A , cilt.27, ss.17-26, 2015 (Hakemli Dergi) Sürdürülebilir Kalkınma

26. A COMPARISON OF SIX TOTAL RNA ISOLATION METHODS FOR DIAGNOSIS OF GYSVD-1 (GRAPEVINE YELLOW SPECKLE VIROID-1) ON VITIS VINIFERA L. LEAVES

Paylan İ. C., Candar A., Gümüş M., Pazarlar S., Önder S.

PAKISTAN JOURNAL OF BOTANY , cilt.46, sa.6, ss.2089-2093, 2014 (SCI-Expanded)

27. First Report of Campylocarpon fasciculare Causing Black Foot Disease of Grapevine in Turkey

Akgül D. S., Güngör Savaş N., Önder S., Özben S., Kaymak S.

Plant Disease , cilt.98, sa.9, ss.1277, 2014 (SCI-Expanded)

28. Ege Bölgesi Bağ Alanlarina Ait Toprakların Bazı Fiziksel Özelliklerinin İncelenmesi

Merken Ö., Önder S.

Türk Tarım ve Doğa Bilimleri Dergisi , sa.1, ss.1101-1102, 2014 (Hakemli Dergi)

29. Detection of Citrus tristeza virus (CTV) from Satsuma Owari mandarins (Citris unshiu) by direct tissue blot immunoassay (DTBIA), DAS-ELISA, and biological indexing

Korkmaz S., Cevik B., ÖNDER S., Koc K., BOZAN O.

NEW ZEALAND JOURNAL OF CROP AND HORTICULTURAL SCIENCE , cilt.36, sa.4, ss.239-246, 2008 (SCI-Expanded)

30. Occurrence and molecular characterization of Turkish isolates of Turnip mosaic virus

Korkmaz S., Tomitaka Y., Önder S., Ohshima K.

PLANT PATHOLOGY , cilt.57, sa.6, ss.1155-1162, 2008 (SCI-Expanded)

31. Edremit Körfez Bölgesi’ndeki Satsuma Owari Mandarinlerinde Yaygın Olan Virüs ve Viroid Hastalıklarının Biyolojik ve Serolojik Yöntemlerle Saptanması

Önder S., Korkmaz S.

JOURNAL OF TEKIRDAG AGRICULTURE FACULTY-TEKIRDAG ZIRAAT FAKULTESI DERGISI , cilt.5, sa.2, ss.205-214, 2008 (Hakemli Dergi)

32. Biological, serological, and molecular characterization of Citrus tristeza virus isolates from different citrus cultivation regions of Turkey

Korkmaz S., Cevik B., Önder S., Koc N. K.

TURKISH JOURNAL OF AGRICULTURE AND FORESTRY , cilt.32, sa.5, ss.369-379, 2008 (SCI-Expanded)

33. Investigation of Biological Properties, Double-Stranded RNA Patterns and Antigen Concentration in Satsuma Owari Mandarins Infected with Citrus tristeza virus in Aegean Region of Turkey

Korkmaz S., Önder S., Gümüş M.

Plant Pathology Journal , cilt.7, sa.1, ss.85-91, 2008 (SCI-Expanded)

34. First report of Turnip mosaic virus on Brassicaceae crops in Turkey

Korkmaz S., Onder S., Tomitaka Y., Ohshima K.

PLANT PATHOLOGY , cilt.56, sa.4, ss.719, 2007 (SCI-Expanded)

35. First report of the presence of Citrus tristeza closterovirus in the Eastern Black Sea Region of Turkey

Korkmaz S., Çevik B., Önder S., Koç N. K.

Journal of Plant Pathology , cilt.88, ss.69, 2006 (SCI-Expanded)

Hakemli Bilimsel Toplantılarda Yayımlanmış Bildiriler 68

1. From Petabases to Pathogens: Viral Discovery in CGIAR tuber crops Genebanks via Scalable Bioinformatics

Önder S., Massart S.

Uluslararası Katılımlı 9. Türkiye Bitki Koruma Kongresi, Ankara, Türkiye, 3 - 05 Eylül 2025, ss.91-92, (Özet Bildiri)

2. Resistance breaking tomato spotted wilt virus (TSWV) Isolates in Marmara Region Tomato Production Areas: Vectors, Tomato Genotypes, and Resistance

Uzunoğulları N., Şafak F., Hantaş C., Sönmez İ., Önder S., Kılıç T., et al.

Uluslararası Katılımlı 9. Türkiye Bitki Koruma Kongresi, Ankara, Türkiye, 3 - 05 Eylül 2025, ss.458-459, (Özet Bildiri)

3. Screening for peach latent mosaic viroid (PLMVd) and plum pox potyvirus (PPV) in Stone Fruit Trees, Bursa and Tekirdağ Provinces and Phylogenetic Analyses

Şafak F., Uzunoğulları N., Önder S.

Uluslararası Katılımlı 9. Türkiye Bitki Koruma Kongresi, Ankara, Türkiye, 3 - 05 Eylül 2025, ss.124-125, (Özet Bildiri)

4. Tomato brown rugose fruit virus (ToBRFV) in Top-View Images of Tomato Plants Using Deep Learning

Kanat F., YILMAZ F., KELEŞ ÖZTÜRK P., EDİZKAN R., YAVUZ H. S., GEREK Ö. N., et al.

10. INTERNATIONAL HASANKEYF SCIENTIFIC RESEARCH AND INNOVATION CONGRESS, Batman, Türkiye, 10 - 11 Mayıs 2025, ss.172-173, (Özet Bildiri)

5. Phytosanitary Challenges in Belgian Viticulture: First Data From Virome Surveys and Producer Interviews

Van Cranenbroeck L., Maertens F., Heyneman M., Maclot F., ÖNDER S., OMMESLAG S., et al.

76th International Symposium on Crop Protection, Ghent, Belçika, 20 Mayıs 2025, ss.42, (Özet Bildiri)

6. Nation-wide virome survey of banana plantationsand surrounding plants in Malawi

Masangwa J. I. G., Temple C., Rollın J., Maclot F., Önder S., Kamwendo J., et al.

International Advances in Plant Virology 2025, Murcia, İspanya, 8 - 11 Nisan 2025, ss.222, (Özet Bildiri)

7. Unveiling Viral And Phytoplasma Threats In Belgian Viticulture: A First Step Toward Virome Analysis

Maertens F., Van Cranenbroeck L., Heyneman M., Ommeslag S., Maclot F., Önder S., et al.

International Advances in Plant Virology 2025, Murcia, İspanya, 8 - 11 Nisan 2025, ss.225, (Özet Bildiri)

8. Exploring a new territory for grapevine viruses: first outputs from winemaker interviews and virome survey in Belgium

Van Cranenbroeck L., Maertens F., Heyneman M., Fontdevila Pareta N., Praet M., Campillo T., et al.

20es RENCONTRES DE VIROLOGIE VÉGÉTALE, Aussois, Fransa, 19 Ocak 2025, ss.33, (Özet Bildiri)

9. Multiplex or generic detection? When false negative results open a brain-teaser to develop a diagnostic test for banana streak virus

ÖNDER S., Massart S.

20es RENCONTRES DE VIROLOGIE VÉGÉTALE, Aussois, Fransa, 19 Ocak 2025, ss.91, (Özet Bildiri)

10. Detection of tomato brown rugose fruit virus in greenhouses using machine learning and computer vision

Yılmaz F., Edizkan R., Keleş Öztürk P., Yavuz H. S., Gerek Ö. N., Önder S., et al.

4th International Conference on Research of Agricultural and Food Technologies (I-CRAFT 2024), Toskent, Özbekistan, 11 - 13 Eylül 2024, ss.135, (Özet Bildiri)

11. An Overview of Grapevine Trunk Diseases and Fusarium Root-Basal Rot in Turkish Grapevine Nurseries

Akgül D. S., Güngör Savaş N., Yıldız M., Bülbül İ., Özarslandan M., Önder S., et al.

XX International Plant Protection Congress , Athens, Yunanistan, 1 - 05 Temmuz 2024, ss.49, (Özet Bildiri)

12. Effectiveness of the Geneious Prime Software in High Throughput Sequencing Data Analysis of Plant Viruses

Önder S.

3rd International Conference on Frontiers in Academic Research, Konya, Türkiye, 15 - 16 Haziran 2024, ss.148, (Özet Bildiri)

13. Comparison of reference genome mapping tools for obtaining the whole genome of plant viruses via high throughput sequencing

Önder S.

2. BİLSEL INTERNATIONAL TURABDİN SCIENTIFIC RESEARCHES AND INNOVATION CONGRESS, Mardin, Türkiye, 4 - 05 Mayıs 2024, ss.88-96, (Tam Metin Bildiri)

14. Comparison of de novo assembly tools for data analysis of High Throughtput Sequencing Results for plant virology

Önder S.

2. BİLSEL INTERNATIONAL TURABDİN SCIENTIFIC RESEARCHES AND INNOVATION CONGRESS, Mardin, Türkiye, 4 - 05 Mayıs 2024, ss.78-87, (Tam Metin Bildiri)

15. Revisiting high throughput sequencing data used for plant virus detection in order to find evidence of non-viral plant pathogens and pests

Haegeman A., Foucart Y., De Jonghe K., Goedefroıt T., Al Rwahnıh M., Boonham N., et al.

12th International Congress of Plant Pathology, Lyon, Fransa, 20 - 25 Ağustos 2023, ss.367-368, (Özet Bildiri)

16. Manisa İli Bağ Alanlarında Phomopsis Çubuk ve Yaprak Lekesi Hastalığının (Phomopsis viticola) Morfolojik ve Moleküler Karakterizasyonu

GÜNGÖR SAVAŞ N., YILDIZ M., ÖNDER S.

10. TÜRKİYE BAĞCILIK VE TEKNOLOJİLERİ SEMPOZYUMU, Manisa, Türkiye, 03 Ekim 2022, ss.64, (Özet Bildiri)

17. Research towards elucidation of the complete genome of grapevine deformation virus isolates in Turkey

Mamedova S., Ulubaş Serçe Ç., Önder S.

IV. International Turkic World Congress on Science and Engineering (TURK-COSE 2022), Niğde, Türkiye, 23 - 24 Haziran 2022, ss.247-254, (Tam Metin Bildiri)

18. Raising awareness among plant virologists on the richness of their high-throughput sequencing data

Haegeman A., Foucart Y., Goedefroit T., De Jonghe K., Al Rwahnih M., Candresse T., et al.

AAB International Advances in Plant Virology - Online, Warwickshire, Birleşik Krallık, 20 - 22 Nisan 2021, (Özet Bildiri)

19. Effects of Shoot Tip Size on Virus Elemination in Grapes

ULAŞ S., ÖNDER S., ÜNAL A.

X. International Scientific Agriculture Symposium ”AGROSYM 2019”, Jahorina, Bosna-Hersek, 3 - 06 Ekim 2019, ss.310, (Özet Bildiri)

20. Next Generation Sequencing (NGS) Applications in Diagnosis of Grapevine Viruses and Viroids

ÖNDER S., ULUBAŞ SERÇE Ç., ÖZTÜRK GÖKÇE Z. N.

1st International Molecular Plant Protection Congress, Adana, Türkiye, 10 - 13 Nisan 2019, ss.90-91, (Özet Bildiri)

21. Molecular Characterization of Grapevine pinot gris virus (GPGV) Isolates by Deep Sequencing

ÖNDER S., OLMOS A.

Final Meeting of COST-DIVAS Action: HTS Technologies for the study and diagnostic of plant viruses, Liege, Belçika, 26 - 30 Kasım 2018, ss.30, (Özet Bildiri)

22. Comparison of Using Total RNA and SiRNA Templates in Next Generation Sequencing for Achievement of Grapevine Viruses and Viroids Detection

ÖNDER S., ULUBAŞ SERÇE Ç., ÖZTÜRK GÖKÇE Z. N., OLMOS A.

Final Meeting of COST-DIVAS Action: HTS Technologies for the study and diagnostic of plant viruses, Liege, Belçika, 26 Kasım 2018, ss.77, (Özet Bildiri)

23. Klonal Preselection in Grapevine Variety Ekşi Kara (Vitis vinifera L.)

Kara Z., Sabır A., Yazar K., Doğan O., Öz M. H., Demirtaş M. N., et al.

VI. International KOP Regional Development Symposium, Konya, Türkiye, 26 - 27 Ekim 2018, (Özet Bildiri)

24. The research on the prevalence of several newly identified grapevine-infecting viruses in Turkey

ÖNDER S., ULUBAŞ SERÇE Ç., ÇİFTÇİ O., ALTAN B., ÖZTÜRK GÖKÇE Z. N., ELÇİ E.

30th International Horticultural Congress, S28- Innovative Plant Protection in Horticulture (2nd International Symposium), İstanbul, Türkiye, 12 - 17 Ağustos 2018, ss.3-4, (Özet Bildiri)

25. Comparison of Different De novo Assembly Tools for Perceiving the Success of Grapevine Viruses and Viroids Detection in Next Generation Sequencing Data via Blastn

ÖNDER S., ULUBAŞ SERÇE Ç., ÖZTÜRK GÖKÇE Z. N., OLMOS A.

30th International Horticultural Congress, S28- Innovative Plant Protection in Horticulture (2nd International Symposium), İstanbul, Türkiye, 12 - 17 Ağustos 2018, ss.30-31, (Özet Bildiri)

26. The Effects of In Vitro Drought Stress on Some Biochemical Properties of Two Grape Rootstocks

ULAŞ S., ÖNDER S., GÜLER A., CANDEMİR A.

IV. International Agriculture Congress, Nevşehir, Türkiye, 5 - 08 Temmuz 2018, ss.234, (Özet Bildiri) Sürdürülebilir Kalkınma

27. Complete Sequence and Molecular Characterization of a Turkish Grapevine Pinot gris virus Isolate

ÖNDER S., ULUBAŞ SERÇE Ç., ÖZTÜRK GÖKÇE Z. N., OLMOS A.

Power of Viruses International Conference, Poreč, Hırvatistan, 16 - 18 Mayıs 2018, ss.91, (Özet Bildiri)

28. Deep Sequencing of Vitis vinifera L. cv. Narince for Diagnosis of Viral Agents

ÖNDER S., ULUBAŞ SERÇE Ç., ÖZTÜRK GÖKÇE Z. N.

I. International Agricultural Science Congress, Van, Türkiye, 9 - 12 Mayıs 2018, ss.473, (Özet Bildiri)

29. Molecular Characterization of Complete Genome of TR-N34 Grapevine Pinot gris virus Isolate in Turkey

ÖNDER S., ULUBAŞ SERÇE Ç.

I. International Agricultural Science Congress, Van, Türkiye, 9 - 12 Mayıs 2018, ss.640, (Özet Bildiri)

30. Occurrence of Grapevine Roditis leaf discoloration-associated virus in Mediterranean Commercial Vineyards in Turkey

ULUBAŞ SERÇE Ç., DOĞANER M. M., ALTAN B., ÖNDER S., ÇİFTÇİ O., ELÇİ E., et al.

19th Congress of the International Council for the Study of Virus and Virus-like Diseases of the Grapevine (ICVG), Santiago, Şili, 9 - 12 Nisan 2018, ss.44-45, (Özet Bildiri)

31. Grapevine Syrah virus-1 and Grapevine Pinot gris virus prevalence and variability in Turkish Grape Varieties

ULUBAŞ SERÇE Ç., ÖNDER S., ÇİFTÇİ O., ALTAN B., ELÇİ E., ÖZTÜRK GÖKÇE Z. N.

19th Congress of the International Council for the Study of Virus and Virus-like Diseases of the Grapevine (ICVG), Santiago, Şili, 9 - 12 Nisan 2018, ss.174-175, (Özet Bildiri)

32. Deep Sequencing of a Local Grapevine Variety in Turkey for Diagnosis of Viruses and Viroids via Next Generation Sequencing Techniques

ÖNDER S., ÖZTÜRK GÖKÇE Z. N., ULUBAŞ SERÇE Ç.

Workshop on the use of NGS technologies for plant pest diagnostics, Bari, İtalya, 22 - 23 Kasım 2017, ss.18, (Özet Bildiri)

33. Diagnosis of Viruses and Viroids via Next Generation Sequencing in Local Grapevine, Turkey

ÖNDER S., ÖZTÜRK GÖKÇE Z. N., ULUBAŞ SERÇE Ç.

Workshop on the use of NGS technologies for plant pest diagnostics, Bari, İtalya, 22 Kasım 2017, ss.18, (Özet Bildiri)

34. Baz Materyal Üretim Sürecindeki Bazı Üzüm Çeşitlerinde Saptanan Virüs Enfeksiyonlarının Değerlendirilmesi

ÖNDER S., ULAŞ S., TOPRAK ÖZCAN E., YILDIZ N., KESGİN M.

9. Bağcılık ve Teknolojileri Sempozyumu, Ankara, Türkiye, 11 - 14 Eylül 2017, (Özet Bildiri)

35. Bornova Misketi Klonlarında Meristem Rejenerasyonlarının ve Virüsten Arındırma Başarısının İncelenmesi

ULAŞ S., ÖNDER S., YILDIZ N.

9. Bağcılık ve Teknolojileri Sempozyumu, Ankara, Türkiye, 11 - 14 Eylül 2017, (Özet Bildiri)

36. Manisa İlinde Bağ Küllemesi (Erysiphe necator Schw.) Hastalığının Mücadelesinde Tahmin ve Erken Uyarı Modeli Kullanım Olanaklarının Araştırılması

GÜNGÖR SAVAŞ N., SAVAŞ Y., ALBAZ E., AKGÜL D. S., ÖNDER S., ONOĞUR E.

9. Bağcılık ve Teknolojileri Sempozyumu, Ankara, Türkiye, 11 - 14 Eylül 2017, (Özet Bildiri)

37. COST Action FA1407: Empowering NGS Technologies for the Study and Diagnostic of Plant Viruses

Ulubaş Serçe Ç., Önder S., Olmos A., Boonham N., Büttner C., Candresse T., et al.

International Workshop Plant Health: Challenges and Solutions, Antalya, Türkiye, 23 - 28 Nisan 2017, ss.62, (Özet Bildiri)

38. New Generation Sequencing Technologies for Diagnosis of Viruses and Viroids in Grapevine

Önder S., Olmos A., Ulubaş Serçe Ç., Öztürk Z. N.

International Workshop Plant Health: Challenges and Solutions, Antalya, Türkiye, 23 - 28 Nisan 2017, ss.55-56, (Özet Bildiri)

39. Strobilurin ve Triazol İçeren İlaçlama Programlarının Cardinal ve Sultani Çekirdeksiz Üzüm Çeşitlerinde Kalite Kriterlerine Etkileri

AKGÜL D. S., ÖNDER S., MERKEN Ö., KESGİN M., YAĞCI A.

3. Ulusal Tarım Kongresi, Afyon, Türkiye, 5 - 08 Ekim 2016, ss.12, (Özet Bildiri)

40. Molecular survey and deep sequencing of Grapevine Pinot gris virus in Turkey

Ulubaş Serçe Ç., Önder S., Çiftçi O., Altan B., Elçi E., Öztürk Gökçe Z. N.

International Advances in Plant Virology (in conjunction with COST Action FA1407), London, Birleşik Krallık, 7 - 09 Eylül 2016, (Özet Bildiri)

41. Grapevine rupestris stem pitting-associated virus (GRSPaV)’ün UPL Probu ile Real-time RT-PCR Sistemiyle Tanılanmasında Dejenere Primer Tasarımı ve Sertifikasyon Analizlerinde Kullanımı

ÖNDER S., ERİLMEZ S., PAYLAN İ. C., CEYHAN M.

Uluslararası Katılımlı Türkiye VI. Bitki Koruma Kongresi, Konya, Türkiye, 5 - 08 Eylül 2016, ss.564, (Özet Bildiri)

42. Tomato spotted wilt virüs (TSWV)’ün Pelargonium spp., Gloxinia spp. ve Dahlia spp. Bitkilerinde Tespiti ve Karakterizasyonu

UZUNOĞULLARI N., ÖNDER S., GÜMÜŞ M.

Uluslararası Katılımlı Türkiye VI. Bitki Koruma Kongresi, Konya, Türkiye, 5 - 08 Eylül 2016, ss.562, (Özet Bildiri)

43. Ege Bölgesi Bağlarında Asma Uru Hastalığı Etmeni (Agrobacterium vitis)’nin Moleküler Karakterizasyonu, Yaygın Asma Anacı ve Üzüm Çeşitlerinin Hastalığa Duyarlılıkları

AKGÜL D. S., ÖZYILMAZ Ü., ÖNDER S., BENLİOĞLU K., ÇELİK Ş., SOLTEKİN R. O.

Uluslararası Katılımlı Türkiye VI. Bitki Koruma Kongresi, Konya, Türkiye, 5 - 08 Eylül 2016, ss.567, (Özet Bildiri)

44. Bağda Külleme Hastalığına (Erysiphe necator Schw.) Karşı Farklı İlaçlama Programlarının Etkinliğinin Belirlenmesi

GÜNGÖR SAVAŞ N., ÖNDER S., ALBAZ E.

Uluslararası Katılımlı Türkiye VI. Bitki Koruma Kongresi, Konya, Türkiye, 5 - 08 Eylül 2016, ss.582, (Özet Bildiri)

45. Detection and Partial Molecular Characterization of Sharka Virus Disease (Plum pox virus=PPV) on Stone Fruit Trees in Marmara Region

UZUNOĞULLARI N., ÖNDER S.

3rd International Symposium on Plum Pox Virus, Antalya, Türkiye, 8 - 13 Mayıs 2016, ss.48, (Özet Bildiri)

46. Biological indexing of Grapevine leafroll-associated viruses (GLRaVs) in Aegean Vineyards, Turkey

ÖNDER S., GÜMÜŞ M.

18th Congress of the International Council for the Study of Virus and Virus-like Diseases of the Grapevine (ICVG), Ankara, Türkiye, 7 - 11 Eylül 2015, ss.176-177, (Özet Bildiri)

47. Comparison of molecular hybridization, real time PCR and classical PCR techniques for diagnosis of GYSVD-1 (Grapevine yellow speckle viroid-1)

PAYLAN İ. C., ÇANDAR A., ÖNDER S., GÜNEŞ N., GÜMÜŞ M.

18th Congress of the International Council for the Study of Virus and Virus-like Diseases of the Grapevine (ICVG), Ankara, Türkiye, 7 - 11 Eylül 2015, ss.206-207, (Özet Bildiri)

48. First Report of Australian grapevine viroid (AGVd) in the Aegean Region Vineyards of Turkey

ÇANDAR A., ÖNDER S., USTA M., PAYLAN İ. C., SİPAHİOĞLU H. M., GÜMÜŞ M.

18th Congress of the International Council for the Study of Virus and Virus-like Diseases of the Grapevine (ICVG), Ankara, Türkiye, 7 - 11 Eylül 2015, ss.196-197, (Özet Bildiri)

49. Molecular characterization of Grapevine yellow speckle viroid 1 detected in the Aegean Region vineyards of Turkey

ÇANDAR A., ÖNDER S., USTA M., PAYLAN İ. C., SİPAHİOĞLU H. M., GÜMÜŞ M.

18th Congress of the International Council for the Study of Virus and Virus-like Diseases of the Grapevine (ICVG), Ankara, Türkiye, 7 - 11 Eylül 2015, ss.198-199, (Özet Bildiri)

50. Partial molecular characterization of Grapevine leafroll-associated virus 4 (GLRaV-4) in Aegean Vineyards, Turkey

ÖNDER S., GÜMÜŞ M.

18th Congress of the International Council for the Study of Virus and Virus-like Diseases of the Grapevine (ICVG), Ankara, Türkiye, 7 - 11 Eylül 2015, ss.178-179, (Özet Bildiri)

51. Occurence of Grapevine leafroll-associated viruses (GLRaVs) in Aegean Vineyards, Turkey

ÖNDER S., GÜMÜŞ M.

18th Congress of the InternationalCouncil for the Study of Virus and Virus-like Diseases of the Grapevine (ICVG), Ankara, Türkiye, 7 - 11 Eylül 2015, ss.44-45, (Özet Bildiri)

52. Ege Bölgesi Bağ Alanlarında Sorun Olan Bazı Viral Etmenlerin Real - Time RT-PCR İle Tanılanması

ÖNDER S., GÜMÜŞ M., PAYLAN İ. C.

VII. Ulusal Bahçe Bitkileri Kongresi, Çanakkale, Türkiye, 25 - 29 Ağustos 2015, ss.144, (Özet Bildiri)

53. RNAi Teknolojisi ve Fitopatolojide Kullanım Alanları

TOPKAYA KÜTÜK B., ÖNDER S., ÇEVİK B.

VII. Ulusal Bahçe Bitkileri Kongresi, Çanakkale, Türkiye, 25 - 29 Ağustos 2015, ss.151, (Özet Bildiri)

54. Ege Bölgesi Bağ Alanlarında Grapevine fanleaf nepovirus (GFLV)’nin Tanılanmasında Konvansiyonel RT-PCR İle Real - Time RT-PCR Tekniklerinin Karşılaştırılması

ÖNDER S., PAYLAN İ. C., ERGÜN M., GÜMÜŞ M.

VII. Ulusal Bahçe Bitkileri Kongresi, Çanakkale, Türkiye, 25 - 29 Ağustos 2015, ss.166, (Özet Bildiri)

55. In Vitro Kuraklık Stresi Uygulamalarının 1613C Asma Anacında Osmotin Gen Ekspresyonuna Etkisi

ULAŞ S., ÖNDER S.

İç Anadolu Bölgesi 2. Tarım ve Gıda Kongresi, Nevşehir, Türkiye, 28 - 30 Nisan 2015, ss.526, (Özet Bildiri) Sürdürülebilir Kalkınma

56. Examination of Some Physical Properties of Aegean Region Vineyard Soils

MERKEN Ö., ÖNDER S.

Agribalkan Balkan Agriculture Congress, Edirne, Türkiye, 8 - 11 Eylül 2014, ss.665, (Özet Bildiri)

57. Ege Bölgesi Bağ Alanlarında Yaprak Kıvrılması Hastalığı ile İlişkili 4 Yeni Ampelovirus

ÖNDER S., GÜMÜŞ M.

Türkiye V. Bitki Koruma Kongresi, Antalya, Türkiye, 3 - 05 Şubat 2014, ss.200, (Özet Bildiri)

58. Ege Bölgesi’nde Yetiştirilen Üzüm Çeşitlerinde Grapevine fanleaf nepovirus (GFLV)’nin Yaygınlık Durumu

ÖNDER S., AKGÜL D. S., GÜMÜŞ M., PAYLAN İ. C.

Türkiye 8. Bağcılık ve Teknolojileri Sempozyumu, Konya, Türkiye, 25 - 28 Eylül 2013, ss.22, (Özet Bildiri)

59. Farklı Asma Anaçları ile Aşılı Red Globe Üzüm Çeşidinin Fidan Randımanı Üzerine Bir Çalışma

İŞÇİ B., ALTINDİŞLİ A., KAÇAR E., DİLLİ Y., SOLTEKİN R. O., ÖNDER S., et al.

Türkiye 8. Bağcılık ve Teknolojileri Sempozyumu, Konya, Türkiye, 25 - 28 Eylül 2013, ss.73, (Özet Bildiri) Sürdürülebilir Kalkınma

60. Triazole ve Strobilurin Ağırlıklı İlaçlama Programlarının Cardinal ve Sultani Çekirdeksiz Asmalarındaki Meyve Kalite Kriterleri ve Yapraklardaki Besin Elementi İçeriğine Etkileri

AKGÜL D. S., ÖNDER S., MERKEN Ö., YAĞCI A.

Türkiye IV. Bitki Koruma Kongresi, Kahramanmaraş, Türkiye, 28 - 30 Haziran 2011, ss.434, (Özet Bildiri)

61. Effects of Fungicide Spray Programs on Quality Criteria in Sultana Seedless Grape

AKGÜL D. S., ÖNDER S., MERKEN Ö., YAĞCI A., UÇKUN Z.

34. World Congress of Vine and Wine, “The Wine Construction”, Porto, Portekiz, 20 - 27 Haziran 2011, (Tam Metin Bildiri) Sürdürülebilir Kalkınma

62. Bağlarımızı Tehdit Eden Önemli Bir Virüs Hastalığı: Grapevine fanleaf nepovirüs (GFLV)

ÖNDER S.

I. Ulusal Sarıgöl İlçesi ve Değerleri Sempozyumu, Manisa, Türkiye, 17 - 19 Şubat 2011, ss.158-164, (Tam Metin Bildiri)

63. Detection and identification of Citrus tristeza virus isolates from different citrus growing regions of Turkey

KORKMAZ S., ÇEVİK B., ÖNDER S., KOÇ N. K.

XVII. Conference of the International Organization of Citrus Virologist (IOCV), Adana, Türkiye, 22 - 26 Ekim 2007, ss.59, (Özet Bildiri)

64. Ege Bölgesi Satsuma Mandarinlerinde Sorun Oluşturan Turunçgil Tristeza Closterovirüsünün (CTV) Biyolojik Özelliklerinin, Double-Stranded Yapılarının ve Antijen Konsantrasyonlarının Belirlenmesi

KORKMAZ S., ÖNDER S., GÜMÜŞ M.

Türkiye II. Bitki Koruma Kongresi, Isparta, Türkiye, 27 - 29 Ağustos 2007, ss.309, (Özet Bildiri)

65. Ülkemiz turunçgil alanlarında Turunçgil Tristeza virüsünün biyolojik, serolojik ve moleküler yöntemlerle tanılanması ve karakterizasyonu

KORKMAZ S., ÇEVİK B., ÖNDER S., KOÇ N. K.

Türkiye II. Bitki Koruma Kongresi, Isparta, Türkiye, 27 - 29 Ağustos 2007, ss.112, (Özet Bildiri)

66. Direkt Doku Bastırma, DAS-ELISA ve Biyolojik İndeksleme Yöntemleriyle Poncirus trifoliata Üzerine Aşılı Satsuma Mandarinlerinde Turunçgil Tristeza Closterovirüsünün (CTV) Tanısının Yapılması

KORKMAZ S., ÇEVİK B., ÖNDER S., KOÇ N. K., BOZAN O.

Türkiye II. Bitki Koruma Kongresi, Isparta, Türkiye, 27 - 29 Ağustos 2007, ss.308, (Özet Bildiri) Sürdürülebilir Kalkınma

67. Güney-Batı Marmara Bölgesinde Şalgam Mozaik Virüsünün (Turnip mosic virus=TuMV) Brassica Cinsi Bitkilerde Biyolojik ve Serolojik Yöntemlerle Saptanması

KORKMAZ S., ÖNDER S.

VI. Sebze Tarımı Sempozyumu, Kahramanmaraş, Türkiye, 19 - 22 Eylül 2006, ss.381-385, (Tam Metin Bildiri)

68. Çanakkale Yöresinde Yetiştirilen Domateslerde Domates Lekeli Solgunluk Virüsünün Serolojik Yöntemlerle Saptanması

TURHAN P., ÖNDER S., KORKMAZ S.

V. Sebze Tarımı Sempozyumu, Çanakkale, Türkiye, 21 - 24 Eylül 2004, ss.250-253, (Tam Metin Bildiri)

Kitaplar 1

1. Bitkisel Üretimde Hastalıklar ve Mücadelesi

KORKMAZ S., ÖNDER S., TURHAN P.

Bahçıvanlık El Kitabı, Şener Sabri, Müftüoğlu Nuray Mücella, Kelkit Abdullah, Editör, As-De Basın Yayın Reklam ve Matbaacılık San.Tic.Ltd.Şti., Çanakkale, ss.223-264, 2005

Diğer Yayınlar 3

1. Asma gövde çukurlaşması virüs hastalığı (Rugose wood complex)”, Bağ Entegre Mücadele Teknik Talimatı

Kaya A., Önder S.

Teknik Rapor, ss.79-80, 2017

2. Asma yaprak kıvrılma virüs hastalığı (Grapevine leafroll associated viruses, GLRaVs), Bağ Entegre Mücadele Teknik Talimatı

Kaya A., Önder S.

Teknik Rapor, ss.77-79, 2017

3. Asma kısa boğum virüs hastalığı (Grapevine fanleaf nepovirus, GFLV), Bağ Entegre Mücadele Teknik Talimatı

Kaya A., Önder S.

Teknik Rapor, ss.75-77, 2017

Metrikler

Yayın

107

Yayın (WoS)

Yayın (Scopus)

H-İndeks (WoS)

Atıf (Scopus)

H-İndeks (Scopus)

Atıf (Scholar)

236

H-İndeks (Scholar)

Atıf (TrDizin)

H-İndeks (TrDizin)

Atıf (Sobiad)

H-İndeks (Sobiad)

Atıf (Diğer Toplam)

Proje

Açık Erişim

BM Sürdürülebilir Kalkınma Amaçları

Yayınlar & Eserler

Yayın

Yayın (WoS)

Yayın (Scopus)

H-İndeks (WoS)

Atıf (Scopus)

H-İndeks (Scopus)

Atıf (Scholar)

H-İndeks (Scholar)

Atıf (TrDizin)

H-İndeks (TrDizin)

Atıf (Sobiad)

H-İndeks (Sobiad)

Atıf (Diğer Toplam)

Proje

Açık Erişim